E39 M5 ankom i 1999 for 2000 model år og markerede den første V-8 motor, der skal anvendes i M produktion bil. Og hvilken motor det er. Den 4,9-liters atmosfæriske V-8 – internt omtalt som S62 – opnår 394 hk ved 6600 o/min og et drejningsmoment på 500 Nm ved 3800 o/min.. Det er et rimeligt motorskrig op til den røde linje ved 7,000 Rpm. Og det kan accelerere fra 0 til 100 km / t på mindre end 5 sekunder. Takket være den variable timing af ventiler til indsugnings- og udstødningsknaster, samt gasspjældets individuelle form, de er blandt de bedste motorer, der nogensinde har forladt de hellige München-haller.