I modsætning til CT og x-ray, Mr anvender ingen farlige stråling. Mere specifikt, aksial scannere bruge en stærk magnetfelt og pulser af radiobølger til at manipulere protoner af brint i den menneskelige krop. Når RF kilden er deaktiveret, brint protoner apokalytoyn deres holdning ved at udsende energi, der er fanget og konverteret til billeder. MR-scanninger er generelt dyrere og tager længere tid end CT-scanninger, men giver mere detaljerede oplysninger. Se denne video, et par slående billeder MR-scanning af den menneskelige krop i aktion.