Toisin kuin CT ja x-ray, MRI käyttää haitalliselle säteilylle. Tarkemmin, aksiaalinen skannerit käyttää esimerkiksi magneettikentän ja radioaaltojen pulssin manipuloida protonit vedyn ihmiskehossa. Kun RF lähde on poistettu käytöstä, Vety protonien apokalytoyn asemaansa säteilevät energiaa, joka on kiinni ja muuntuvat kuviksi. MRI-tutkimukset ovat yleensä kalliimpia ja kestävät kauemmin kuin CT-skannaukset, mutta tarjota yksityiskohtaista tietoa. Katso tämä video, myös joitakin hätkähdyttäviä kuvia MRI ihmiskehon toiminnassa.