E39 M5 הגיע בשנת 1999 לשנת דגם 2000 וסימן את מנוע ה- V-8 הראשון ששימש במכונית הייצור M.. ואיזה מנוע זה. ה-V-8 האטמוספרי בנפח 4.9 ליטר - המכונה באופן פנימי S62 - משיג 394 כ'ס ב-6600 סל'ד ומומנט של 500 ננומטר ב-3800 סל'ד. זה צרחת מנוע הוגנת עד לקו האדום בשעה 7,000 סל ד. והוא יכול להאיץ בין 0 ל -100 קמ'ש בפחות מחמש שניות. בזכות התזמון המשתנה של השסתומים עבור פלטות הכניסה והפליטה, כמו גם את הצורה האישית של המצערת, הם בין המנועים הטובים ביותר שעזבו אי פעם את אולמות מינכן הקדושים.