E39 M5 kom i 1999 for 2000-modellåret og markerte den første V-8-motoren som ble brukt i M-produksjonsbilen. Og hvilken motor det er. Den 4,9-liters atmosfæriske V-8 – internt referert til som S62 – oppnår 394 hk ved 6600 o/min og et dreiemoment på 500 Nm ved 3800 o/min.. Det er et rimelig motorskrik opp til den røde linjen på 7,000 RPM. Og den kan akselerere fra 0 til 100 km/t på mindre enn 5 sekunder. Takket være variabelen for ventiler for inntaks- og eksosrør, samt gassens individuelle form, de er blant de beste motorene som noensinne har forlatt de hellige München-hallene.